Le minaret construit par Abderraman III est conservé à l'intérieur du clocher actuel. Le "Calbido Catedralicio" prit l'initiative de le restaurer en 1593, car il avait été endommagé lors d'une tempête.
Ce projet fut mené à terme par Hernan Ruìz II qui détruisit en partie l'ancien minaret pour construire le clocher. Les travaux continuèrent au XVIIe siècle, avec la construction par Juan sequero de Matilla du corps de l'horloge. La cloche est l'oeuvre de Gaspar de la Peña qui la réalisa en 1664. La statut de San Rafael sur la tour correspond aux sculpteurs Bernabé Gómez del Río et à Pedro de la Paz.
